水中木作为航行中遇到的特殊植物，是可以通过种子种植到基地附近，巨大的水中木提供的阴凉地也是很多的，除此之外还有着防雨、防雷、防自燃、防过热等多个好处。水中木的种植简单来说，就是划船航行，找到水中木区域后用船撞击水中木，每个水中木都是会掉落一个种子，如果钓到海里的种子，就需要用特殊机器打捞，将其带到家附近丢到海中就能种植。
当然在这一流程里是有着很多细节需要注意，首先就是要获取打捞种子的夹夹绞盘，物品的制作需要与NPC珍珠增进好感，后续才能解锁蓝图。这样玩家就能制作夹夹绞盘放到船上了，掉落在海里的种子可以打开地图，种子也是会有图标显示，对准种子的位置就可以打捞上来。种子的打捞并不是流程的结束，玩家还要顺手摘下水中木藤蔓上的无花果，这会是后续种子生长重要的肥料资源。
需要注意的是在摘掉无花果后，是会有特殊蜘蛛出现，为了方便后续前来此地被蜘蛛干扰，玩家可以用火烧掉巢穴，留下蜘蛛巢残骸不管即可防止蜘蛛刷新。水中木种子和大理石雕像一样，属于较重的物品，并且不能放在背包栏中，除了将船只划到离家较近的位置，在需要走的路径上建议通过牛、传送道具快速搬运。来到家附近的水域，借助夹夹绞盘将种子丢到海里，能看到水中种子的阴影，也就可以正常生长了。
